El transporte en ferrocarril en Chile se inicia el año 1851 en el norte y luego prolifera rápidamente con ferrocarriles privados que transportaban minerales como salitre y cobre en el norte y carbón en el sur. A fines del siglo XIX el Estado Chileno comenzó adquirir estos trenes privados y se expande la red para servicios de carga y pasajeros. Dicha expansión se prolongó hasta fines de la década del 70 en donde producto de una disminución de la inversión en el modo ferroviario, éste comienza a deteriorarse y a entrar en una clara etapa de reducción del transporte de carga, su cobertura y de la calidad del servicio.

Ferrocarril del Pacífico S.A. (Fepasa) se constituyó el 15 de septiembre de 1993, a fin de que la Empresa de los Ferrocarriles del Estado (EFE) desarrolle indirectamente su giro propio de transporte de carga separándolo del servicio de transporte de pasajeros. El objetivo de Fepasa sería entonces, establecer, desarrollar, impulsar, mantener y explotar servicios de transporte de carga a realizarse por medio de vías férreas o sistemas similares y servicios de transporte complementarios, cualquiera sea su modo, incluyendo todas las actividades conexas necesarias para el debido cumplimiento de esta finalidad.

El año 1994 EFE vende por medio de una licitación el 51% de la propiedad de Fepasa al sector privado, el cual asume la administración de la compañía en enero de 1995 a través del consorcio Transportes del Pacífico.

La concesión otorgada a Fepasa por el transporte público de carga en las líneas férreas de EFE entre la V y X región es por 20 años a partir del año 1995 renovable por diez años más.

En el año 2002 se créa la División de camiones, cuyo objetivo es realizar los servicios de transporte en camión de la compañía tanto para los porteos requeridos para completar el servicio del ferrocarril puerta a puerta como para servicios directos de transporte en camión.

En el año 2003 se materializa un cambio de control de la compañía posterior a un proceso de oferta pública de acciones en el cual Puerto Ventanas S.A. asume el control de Fepasa.

Durante estos años el transporte de carga realizado por Fepasa ha tenido una fuerte dinámica. Si bien en un principio se produjo una baja debido al ajuste que significó el traspaso de la empresa a privados, a partir de 1997 mediante una fuerte inversión en rehabilitación e incorporación de nuevos equipos y una orientación enfocada a mejorar el servicio al cliente esta situación comenzó a revertirse hasta reflejar incrementos significativos los últimos seis años.